（一）門戶網站主要功能
門戶網站（www.innocom.gov.cn）的主要功能包括：發布高新技術企業政策、工作動態、公示文件，公告備案、更名、異地搬遷、撤銷資格、問題中介機構名單等信息，以及提供管理系統的登錄入口。
（二）管理系統主要功能
管理系統由企業申報系統、認定機構管理系統和領導小組辦公室管理系統三個子系統組成。
1.企業申報系統主要功能
（1）企業注冊
（2）企業信息變更
（3）企業名稱變更
（4）認定申報
（5）年度發展情況報表
（6）查詢
（7）密碼找回
2.認定機構管理系統主要功能
（1）企業注冊管理
（2）認定申報管理
（3）撤銷企業高企證書管理
（4）異地搬遷企業管理
（5）查詢與統計
3.領導小組辦公室管理系統主要功能
（1）高企備案管理
（2）撤銷企業高企證書管理
（3）異地搬遷企業管理
（4）查詢與統計